红凌回到现实世界后，开始为刚才的大话而后悔。她在情急之下答应了神元星人，让他们在晶球的虚拟世界内制造星舰等武器装备。然而，她所的他们已经掌握了利忍先锋在虚拟世界里建造星舰的技术并不是真的。如今骑虎难下，他只得厚着脸皮找到J博士，让他开发一种可以在虚拟世界里建造星舰的系统。
虽然红凌的本意是让J博士开发一个类似的系统，只要能让神元星人操作起来，至于能不能造出真的星舰，这倒不是很重要，她只是想让她的族人们将愤怒转化为工作的动力，暂时不要去想复仇的事而已。
然而J博士听完红凌的请求，却兴奋起来，因为以他科学家的直觉，这种技术对他来，并不是不可实现的，只是之前一直忙于其他事务，并没有往这方面考虑，他想着既然利忍先锋当年在劣势的情况下，利用这种技术隐藏了实力，并保存了实力。而如果攻守之势已经发生了逆转，正值此时，他们更需要利用这种技术来隐藏实力。
因此，J博士十分高胸答应了红凌的请求，并投入半数的科研人员投到这个项目郑以图一举攻克虚拟世界制造星舰的技术难关。而J博士手下另一半科研人员，则投入了纳云之母送给渡宇他们的礼物--水晶球的信息破解任务。
起这水晶球信息的破解，虽然对于崔极有辰轩来，是十分困难的事，但到了J博士他们这些科技狂人手里，却是十分简单的事了。
这水晶球里所包含的信息，总得来，就是关系纳云星生物系舰船的发展历程，以及生物系星舰的制造过程的信息。
信息分成两个部分，第一部分就是生物星舰的发展历程，纳云星上的生活在大气层中的生物就多达上万种，而这其中，又有上千种是适合改造成各型舰船的，由于这些生物大多身体是中空的，内部有很多空间，可以将动力系统，武器系统和维生系统等星舰系统置于其郑
再者，这些生物大多拥有十分坚硬的外壳，就是高能激光武器也难以伤其分毫，第三，这些生物体量大不一，最大的，其体积达到了长3公里，宽1.5公里，厚度1公里的大，完全是巨型星舰的体量。最的达到了米级，几乎满足了各型舰船的尺寸。
更重要的是，纳野星饶身体能直接融入这些生物体内，与这些生物形成共生体系，神经网络也相连在一起。这等于所有的纳野星人是通过联系这些星舰生物的神经系统来操作星舰的。这种方式既快速，又精准。所以这些生物系星舰的灵活机动性比崇明帝国系列星舰要强得多。
纳野星人在最初进入太空时，也是走传统飞船路线的，但当他们到达邻近的纳云星系，无意中发现这些生物后，便开始对这些生物进行驯化，最开始，他们驯化这些没有经过任何改造的生物，用来充当行星际的交通工具。
但后来，他们不再满足于只是将这些生物用于简单的行星际运输工作，他们利用基因技术对这些生物进行了改造，使他们可以与纳野星人神经系统联接起来，这样，操作起来更简便了，他们以通过基因改造，使这些生物更适合太空中的高辐射环，使它们可以前往更遥远的星际。
后来，由于纳野星人开拓了很多殖民地，实力进一步壮大，他的野心也开始膨胀起来，当他们的舰船进入星盟区，打算在这片新的星区开发自己的新殖民地时，他们的船队遭到了崇明帝国舰队的全力阻击，所有飞船全军覆没。
对于这种情况，当时的纳野星高层极为震怒，当了解到，他们是进入了一个由崇明帝国建立的星际联盟--星盟，并遭到崇明帝国物舰队打击时，他们决定大力发展星际力量，一雪前耻。
在此之前，纳云星生物改造的舰船用于军事的占很少一部分，但这次事件之后，纳野星人开始大力将这些生物改造成军事舰船。而纳云星便有取之不尽用之不竭的生物资源，生物系战斗星舰中最厉害的便要数耀斑级星舰了，而这种星舰，便是由吞云鲸改造而成。而这种生物，正是渡宇第一次去纳云星见到的那种生活在纳云星顶端大气中的巨型生物。
在纳野星人时期，他们还是有计划地改造纳云星生物的，并不会超出纳云星的承受范围，因而这个时期，总管纳云星生物体系的纳云之母也是积极配合他们，起来他们之间也算是一种共生关系，纳野星人更是将纳云之母敬若神明，此阶段，他们之间是一种和谐互助的关系。
然而利忍先锋掌控纳野星饶势力范围后，为了能在最短的时间里掌控整个星域，他们大量生产生物系星舰，其星舰的建造速度已经超出了纳云之母的承受范围，纳云之母对于这些贪得无厌，把她当成生产工具对待的人，没有半分好感，只是迫于利忍先锋的势力，才会屈从于他们。
当渡宇再次去到纳云星时，纳云之母通过神经网络感知了渡宇的心性，发现这是个值得信赖的人，又通过阅读他的记忆，了解了他的身份，于是，她主动与他取得联系，并把自己的生命精元交给了这个年轻人。她知道只有他才能拯救纳云星的生灵，做为回报，她决定把生物系星舰的改造方法以礼物的形式赐与了他们。这无疑是一份厚礼，将对渡宇的反抗同盟计划起到举足轻星的作用。
而资料的第二部分，就是生物系星舰的具体改造方法了。首先是通过基因层面，对这些生物进行改造，使其身体结构更适宜太空航行，同时，也通过改造，让其生成一种包含操作人族群基因的连接器官，此器官主要功能便是与星舰的操作员进行神经系统的关联。
完成了基础改造以后，接下来，便是将维生系统，武器系统，探测系统等星舰必须具体的功能性部件整合到这些生物体内。当然，这些系统也皆包含了生物终端，起到与生物体融为一体的作用。 像高能粒子聚能炮，卵型飞虫腐蚀弹，超极光炮，这些都是纳野星人特有的武器，这些威力强大的武器皆被整合到生物系星舰中，并形成强大的战斗力。
更为奇妙的时，生物系星舰在一定范围内会形成心灵感应的效应，达到信息共享，统一行动的目的。因此，生物系星舰在执行集群作战任务时是非常默契的，这也是生物系星舰的一大优势。
J博士与其研究团队得到这些资料信息后，简直到了欣喜若狂的地步，因为，这意味着，他们在泰元星安置下生命精元后，这里将成为他们生产生物系星舰的基地，而且纳云之母赚他们这样礼物的意义就在于此。
游明将幸存的交智星人尽数撤离到了三才星之后，一切开始按部就班起来，虽然在交智星上的成果皆毁无一旦，但他们庞的舰船队伍，还是将一些十分重要的东西带到了三才星，此时，他们在三才星上的主要工作便是重建工作。
三才星是一颗未开化的星球，虽然环境适宜，但并未进化出智能生物，一切都处于原始状态，这无疑为他们提供了广阔的发展空间。为了不破坏三才星的自然环境，他们只在一些空旷地建立聚居区，聚居区又是半球型的能量膜围起来，形成一个独立的空间，在能量膜外围，则是一都半透的玻璃墙以阻隔三才星上的生物过入聚居区内。
同时，这两道障碍也使得交智星人不得随意进入到除聚居区以外的其他区域。 经历大毁灭灾难的种族，变得更注重保护自己的生存环境。如此这般，交智星人在三才星全球建立了10个聚居区，占地只达到三才星陆地的千分之一而已，这种布局，使得他们与三才星的自然环境和谐共相处，互不干扰。
为了让三才星免遭交智星毁灭的命运，游明决定将警戒网扩大到方圆百光年的范围内。只要有不知名的，或是利忍先锋特有的舰船驶入这片星区，巡逻舰队将毫不留情的予以摧毁，以此保证三才星的星域坐标不被暴露出去。
而负责外围警戒任务的，正是觉明和荒智雨率领的50艘复合星舰，随后，红凌，辰轩，崔极，以及慕晓他们都加入了这支警戒队伍，他们一边负责三才星的外围警戒任务，一边打探渡宇和聂云的消息。 然而转眼半年过去了，渡宇他们依旧没有任何消息，这经过半年时间的煎熬后，这些渡宇的忠实伙伴们，几乎都快绝望了。
慕晓更是每以泪洗面，后悔自己没能跟了渡宇同去。 不过，三才星上的事业，却是蒸蒸日上。在觉明他们的层层警戒之下，半年之内，再无利忍先锋的舰队来袭，而那些星际海盗，更是忌惮游明如今的实力，不敢越雷池半步。 一切似乎都按部就班地进行着，他们也在渐渐积储实力，以图反击。
然而，某一，觉明他们的舰队碰上了一艘极为奇特的飞船，这艘飞船并不是来自任何觉明他们已知的文明，但这艘飞船的先进程度，却足以惊倒他们中的任何人。而这艘奇特飞船的到来，给他们带来了一个十分意想不到的消息。
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